Desenvolver projetos de pesquisa e extensão voltados ao entendimento da dinâmica, qualidade e gestão das águas superficiais e subterrâneas de modo a possibilitar o seu uso sustentável a partir das condições ambientais naturais e conforme os padrões estabelecidos na legislação regional, nacional e internacional. Desenvolver modelos de gestão integrada das águas superficiais e subterrâneas, apoiando órgãos ambientais, comitês de bacias hidrográficas e a gestão das áreas costeiras.